做NCOA4的WB实验真的栓Q……这些坑我踩完了,保姆级方案码住了!(wb实验操作步骤)

刚接触NCOA4的WB实验时,我完全是一头雾水。查资料才知道,它有两个亚型:

α亚型理论分子量70kDa,但实际跑胶常出现在80-95kDa;

β亚型小一些,287个氨基酸,理论31kDa,但条带容易模糊,还可能被其他条带掩盖。

另外,它在不同组织里表达差异特别大。最麻烦的是它容易降解,因为和铁蛋白自噬有关,稍微处理不好就被蛋白酶水解了。这些特性让我一开始的实验频频翻车。

一、刚开始做实验时,我遇到的坑……

(一)信号弱到看不见,加样加到心疼

第一次跑胶,按常规加了20μg细胞总蛋白,结果曝光后膜上干干净净,啥条带都没有。后来加到30μg还是不行,一度怀疑抗体有问题(其实是操作细节没做好)。

(二) 条带“乱跑”,位置完全对不上

目标是α亚型(70kDa),结果跑出来条带在90kDa左右,Marker位置明明对得上,就它“跑偏”,换了新胶还是这样,特别懵。

(三) 背景高,目标条带被淹没

好不容易有信号了,但背景一片黑,目标条带根本分不清,洗膜洗了好几次都没用,浪费了好多膜和抗体。

(四)转膜完膜上啥也没有,蛋白全在胶上

有一次转膜后用丽春红染膜,发现胶上还有大量蛋白,膜上只有淡淡痕迹,等于白转了,浪费了我一天时间。

二、踩过很多坑后,我悟了❗❗❗

(一) 针对“信号弱/无条带”:从样品处理到转膜,每个环节都不能马虎

上样量得按表达量调整:低表达细胞得加到30-40μg总蛋白,高表达组织20μg就够,加太多反而容易过载。

(二)转膜条件分亚型设置:

1. α亚型(70kDa+):用0.45μm PVDF膜,湿转恒流250mA,4℃转90分钟(全程冰浴,避免高温失活);

2. β亚型(31kDa):用0.22μm PVDF膜,恒流300mA,4℃转45分钟(小分子容易穿透,时间不能太长)。

3. 裂解液必须加足抑制剂:之前只用基础裂解液,蛋白容易降解。后来换成RIPA缓冲液(50mM Tris-HCl pH7.4, 150mM NaCl, 1% NP-40, 0.1% SDS),加1×蛋白酶抑制剂混合物和1×磷酸酶抑制剂,冰上裂解30分钟,离心取上清,信号明显出来了。

(三) 针对“条带飘移”:胶浓度要匹配分子量

条带位置不对,原来是胶浓度不合适。α亚型分子量较大,用8%-10%的梯度胶(孔径大,适合大分子分离);β亚型小,用15%的胶(孔径小,小分子分离更清楚)。换了梯度胶后,条带位置和预期完全对得上,再也没“跑偏”过。

(四) 针对“背景高”:封闭剂选对很关键

一开始用脱脂牛奶封闭,背景总是很高。后来试了5% BSA(用TBST配置),室温封闭1小时,背景明显干净了。抗体稀释比例也要注意:一抗1:1000,4℃孵育过夜(比室温孵育1小时信号强很多);二抗1:5000,TBST洗3次,每次10分钟,洗干净背景就低了。

(五)针对“转膜失败”:细节决定成败

转膜前一定要活化PVDF膜:用甲醇浸泡30秒,不然蛋白结合不上。转膜缓冲液提前4℃预冷,转膜时用冰浴降温,避免缓冲液升温过快。转膜时用玻璃棒把气泡擀平,防止局部没转上。转完用丽春红染膜检查,确认蛋白转到膜上再进行下一步,避免后续浪费。

三、最后总结几点,收藏起来直接用❗

做NCOA4 WB这半年,从啥也跑不出来到现在条带稳定,最大的感受是:细节太重要了。总结几个关键要点:

(一)先明确目标亚型:α和β的膜孔径、胶浓度、转膜时间都不一样,别混着用;

(二)温度控制好:裂解、转膜全程4℃,避免蛋白降解或修饰丢失;

(三)封闭用BSA:背景高的时候别执着于牛奶,换BSA试试;

(四)转膜后必验证:丽春红染膜花不了几分钟,能避免后续白忙活。

实验刚开始踩坑很正常,多查文献、多试几次,总能摸出规律。希望我的经历能帮学弟学妹们少走点弯路!

特别声明:[做NCOA4的WB实验真的栓Q……这些坑我踩完了,保姆级方案码住了!(wb实验操作步骤)] 该文观点仅代表作者本人,今日霍州系信息发布平台,霍州网仅提供信息存储空间服务。

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