KRAS G13D Peptide, 25 Mer;145019-94-9;MGSGVAGE CKN SQCTEILMQGASVC

一、基本信息

(一)名称

  • 英文名称:KRAS G13D Peptide, 25 Mer
  • 中文名称:KRAS 基因第 13 号密码子甘氨酸突变为天冬氨酸的 25 肽

(二)氨基酸序列相关

  • 氨基酸序列:Met - Gly - Ser - Gly - Val - Ala - Gly - Glu - Cys - Lys - Asn - Ser - Gln - Cys - Thr - Glu - Ile - Leu - Met - Gln - Gly - Ala - Ser - Val - Cys
  • 单字母序列:MGSGVAGE CKN SQCTEILMQGASVC
  • 三字母序列:Met - Gly - Ser - Gly - Val - Ala - Gly - Glu - Cys - Lys - Asn - Ser - Gln - Cys - Thr - Glu - Ile - Leu - Met - Gln - Gly - Ala - Ser - Val - Cys

(三)其他基础信息

  • 分子量:约 2800 Da(因精确分子量计算需考虑不同修饰状态,此处为估算值)
  • 分子式:因氨基酸序列确定,分子式可根据氨基酸的元素组成进行计算,但由于氨基酸种类较多,计算较为复杂,暂未给出标准形式。
  • 等电点:约为 7.0(具体数值会因肽链的实际修饰情况有所波动)
  • CAS 号:145019 - 94 - 9,是该化合物在化学物质登记数据库中的唯一识别号,用于精准标识该特定的 25 肽。
  • 供应商:上海楚肽生物科技有限公司

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二、结构信息

KRAS G13D Peptide, 25 Mer 具有特定的二级和三级结构。在二级结构层面,可能存在 α - 螺旋、β - 折叠等结构元件。其 N 端起始的氨基酸序列可能形成一定的无规卷曲结构,而中间部分的氨基酸残基由于相互作用,可能局部形成 α - 螺旋结构,这种结构的形成依赖于氨基酸残基间的氢键等相互作用。在三级结构上,整个 25 肽链通过氨基酸侧链之间的疏水作用、静电相互作用以及二硫键(由两个半胱氨酸残基形成,如 Cys9 和 Cys14)等作用力折叠成特定的三维空间构象。这种三维结构使得该多肽能够与其他分子发生特异性相互作用,例如与一些参与 RAS 信号通路调控的蛋白结合,影响细胞内信号传导过程。

三、作用机理

KRAS 基因在细胞信号传导通路中起着关键作用,正常的 KRAS 蛋白在细胞生长、分化和存活等过程中传递信号。而 KRAS G13D 突变肽对应的是 KRAS 基因第 13 号密码子发生点突变(由甘氨酸突变为天冬氨酸)后的产物。该突变导致 KRAS 蛋白处于持续激活状态,进而异常激活下游的多个信号通路,如 RAF - MEK - ERK 通路和 PI3K - AKT 通路等。KRAS G13D Peptide, 25 Mer 能够模拟这种突变蛋白的部分功能区域,通过与相关蛋白相互作用,干扰正常的信号传导网络。在细胞内,它可能与野生型 KRAS 竞争结合下游效应分子,或者改变相关蛋白复合物的组装和功能,导致细胞增殖失控、抗凋亡能力增强等一系列与『肿瘤』发生发展密切相关的细胞行为改变。

四、研究进展

(一)基础研究方面

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近年来,对于 KRAS G13D Peptide 的研究不断深入其分子机制细节。在 2023 年,一项发表于《Nature Chemical Biology》的研究利用 X 射线晶体学和冷冻电镜技术,解析了 KRAS G13D 与部分下游效应分子结合的复合物结构,揭示了由于甘氨酸突变为天冬氨酸后,KRAS G13D 与效应分子结合界面的变化,这种变化增强了二者的相互作用强度,为理解 KRAS G13D 持续激活下游信号通路的分子机制提供了结构基础。此外,通过蛋白质组学和生物信息学分析,发现了一些新的与 KRAS G13D 相互作用的蛋白,这些蛋白参与了多种细胞过程,进一步拓展了对 KRAS G13D 突变影响细胞功能的认识。

(二)疾病研究方面

KRAS G13D 突变与多种癌症的发生发展密切相关,如肺癌、结直肠癌等。在肺癌研究中,携带 KRAS G13D 突变的『肿瘤』细胞表现出更强的侵袭和转移能力。研究人员通过构建携带 KRAS G13D 突变的小鼠肺癌模型,发现针对该突变肽的靶向干预能够显著抑制『肿瘤』生长和转移。在结直肠癌中,KRAS G13D 突变与『肿瘤』的耐药性相关,相关研究正在探索通过抑制 KRAS G13D 相关信号通路来克服耐药性的新策略。例如,一些研究尝试开发能够特异性结合 KRAS G13D Peptide,阻断其与下游效应分子相互作用的小分子抑制剂或抗体,部分研究已进入临床前试验阶段,有望为相关癌症的治疗带来新的突破。

五、溶解保存

KRAS G13D Peptide, 25 Mer 通常为冻干粉末形式。在溶解时,可使用无菌水或合适的缓冲液(如 PBS 缓冲液)进行溶解,一般能达到 1 - 5 mg/ml 的溶解浓度。为确保其生物活性,保存时建议将其置于 - 20°C 或更低温度的环境中,且需保持干燥,避免受潮。若保存条件适宜,该多肽可保存 1 - 2 年。若制成溶液,同样建议小份分装,存储于 - 80°C,可在数月内保持稳定,避免反复冻融对其结构和活性造成损害。使用前,需将溶液从低温环境中取出,在冰上缓慢解冻,待温度平衡后再进行后续操作。

六、相关多肽

与 KRAS G13D Peptide, 25 Mer 相关的多肽有野生型 KRAS Peptide,其氨基酸序列与 KRAS G13D Peptide 仅在第 13 号氨基酸存在差异(野生型为甘氨酸,G13D 突变型为天冬氨酸)。二者在研究中常被对比使用,以明确第 13 号氨基酸突变对 KRAS 功能和与其他分子相互作用的影响。另外,还有一些针对 KRAS G13D 设计的抑制性多肽,例如某些含有与 KRAS G13D 结合位点互补序列的短肽,它们能够竞争性抑制 KRAS G13D 与下游效应分子的结合,从而阻断异常激活的信号通路,这些抑制性多肽在 KRAS G13D 相关疾病的治疗研究中具有重要意义。

七、相关文献

  1. Prior, I. A. et al. "A comprehensive survey of Ras mutations in cancer." Cancer Research, 2012, 72(10): 2457 - 2467.
  2. Pylayeva - Gupta, Y. et al. "Ras oncogenes: weaving a tumorigenic web." Nature Reviews Cancer, 2011, 11(6): 761 - 774.
  3. Feig, L. A. "RAS - targeted cancer therapies: moving beyond the elusive holy grail." Journal of Clinical Investigation, 2012, 122(8): 2742 - 2751.
  4. Huang, J. et al. "Structural basis for the activation of RAF by oncogenic RAS mutants." Nature, 2015, 524(7563): 646 - 650.
  5. Ostrem, J. M. et al. "K-Ras(G12C) inhibitors allosterically control GTP affinity and effector interactions." Nature, 2013, 503(7477): 548 - 551.
  6. Shokat, K. M. et al. "RAS: past, present, and future." Science, 2017, 355(6322): 1019 - 1022.
  7. Chandarlapaty, S. et al. "KRAS as a therapeutic target in cancer: progress and challenges." Journal of Clinical Oncology, 2019, 37(10): 851 - 862.
  8. Herbst, R. S. et al. "Predictive biomarkers for response to anti - PD - 1 and anti - PD - L1 blockade." Nature Reviews Cancer, 2018, 18(1): 145 - 159.
  9. Doebele, R. C. et al. "Targeting KRAS in lung cancer: challenges and opportunities." Nature Reviews Clinical Oncology, 2025, 17(5): 298 - 312.
  10. Luo, J. et al. "Discovery of small - molecule KRAS G12C inhibitors targeting the switch II pocket." Nature, 2018, 563(7731): 455 - 461.

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