“寄生虫”DNA🧬片段会破坏癌症基因组稳定性

科技日报北京2月27日电 (记者张梦然)27日的《科学》杂志发表了一项研究,揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA🧬片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1(L1)元件,如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的温床,为恶性细胞提供了更多生长、适应和逃避治疗的机会。该研究挑战了传统观点,发现了对癌症基因组有全面影响的一个关键因素。

西班牙巴塞罗那基因组调控中心联合多国团队此次聚焦于『肿瘤』中异常活跃的L1元件,并采用长读长测序新技术,首次完整描绘了这类“跳跃基因”对癌症基因组结构的全面影响。他们发现,L1不仅能通过插入突变破坏单个基因,更能驱动大规模且具有破坏性的基因组结构重排,例如缺失、易位等。在分析的10个L1高活性『肿瘤』中,共观察到6418次跳跃事件,其中大约每40次跳跃就会引发一次大规模结构改造,这种重排有3/4是传统短读长测序技术难以检测的。

尤为重要的是,约65%的L1事件发生在『肿瘤』演化的早期阶段,且大多出现在“全基因组倍增”(癌细胞复制整套染色体)这一重要事件之前。这表明L1的活跃是癌症形成初期基因组重塑的重要促成因素,而非结果。此外,『肿瘤』组织中L1启动子区域甲基化水平较低的现象,也与表观遗传变化可能唤醒这些休眠元件的假说相符。

这项由多国机构合作完成的研究,尽管样本集中于L1活性极高的癌症类型,但其发现为理解癌症基因组不稳定的根源提供了新视角。这也强调了长读长测序在癌症研究中的潜在价值,有望为未来开发早期干预策略指明新方向。

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