AF647 NHS ester (6C-Linker)；407627-60-5； AF系列荧光染料 #科技 #分子 #基团 #荧光 #CLinker #系列

AF647-NHS ester 是 Alexa Fluor 647 (AF647) 的类似物。NHS ester 能够与带有氨基的分子 (如蛋白质、抗体等) 发生共价结合。AF647 是一种远红光荧光染料。

一、基本信息

英文名称：AF647 NHS ester (6C-Linker)、Alexa Fluor 647 NHS ester (6-carbon linker)
中文名称：AF647 琥珀酰亚胺酯（6 碳连接臂）
CAS 号：407627-60-5
分子式：C₄₀H₄₉N₃O₁₆S₄
分子量：956.09
结构图：

二、关键光学性能

荧光波段为远红光区，与 AF647 系列通用光学参数匹配，最大激发波长（Ex）≈650 nm，最大发射波长（Em）≈665 nm，精准适配流式细胞仪、激光共聚焦显微镜🔬、荧光显微镜🔬的远红光 / 红色检测通道；可与 AF488、AF555 等绿色、橙色荧光染料搭配实现多色荧光标记，信号无交叉干扰，背景低、信噪比高。

核心光学优势：荧光亮度高，摩尔消光系数优异；光稳定性突出，抗光漂白能力强，适合长时间连续荧光成像与检测；荧光信号在 pH 4.0-10.0 范围内无显著淬灭，适配细胞裂解液、血清、组织切片等复杂生物样本，标记后荧光性能无衰减。

三、溶解性与保存条件

溶解性：易溶于 DMSO、DMF 等有机溶剂，可在低比例有机相的 PBS/HEPES 缓冲液中稳定分散，标记实验建议用无水 DMSO 配制 10 mM 母液，再按实验需求稀释至工作浓度，无需高比例有机相助溶，适配生物体系温和反应。

保存条件：粉末状态需 - 20℃干燥避光密封保存，加入硅胶干燥剂，避免反复冻融、高温与潮湿环境，真空密封状态下有效期 24 个月；DMSO 母液需小体积分装避光冻存，有效期 6 个月，实验时现配现用，避免母液反复冻融导致活性基团失效。

四、结构与反应特性

结构核心：以 Alexa Fluor 647 经典远红光荧光母核为基础，末端通过6 碳柔性连接臂连接 NHS ester 活性基团；6 碳连接臂为柔性直链结构，相比短链连接臂，能有效减少荧光基团与目标分子之间的空间位阻，降低对目标分子构象的影响，同时提升染料在水相反应体系中的分散性，避免荧光基团聚集淬灭；NHS ester 为伯胺特异性活性位点，无额外非特异性结合位点。
靶向反应特性：NHS ester 活性基团可特异性与蛋白、多肽、核酸等生物分子上的伯胺基团（如赖氨酸残基、N 端氨基、人工修饰氨基位点）发生酰胺化反应，形成稳定不可逆的共价酰胺键，对巯基、羧基等其他基团无交叉反应，标记特异性高。
偶联实验条件：最佳反应体系为 pH 7.0-8.5 的 PBS/HEPES 缓冲液，室温避光反应 30-60min 即可实现高效偶联；染料与目标分子的摩尔比建议控制在 5:1~20:1，可根据目标分子的伯胺数量灵活调整；反应体系中需避免含 Tris、甘氨酸等游离胺类物质，防止其与活性基团竞争结合，降低标记效率。

五、核心应用场景

常规生物大分子标记：用于抗体、抗原、多肽、酶、核酸等生物大分子的特异性荧光标记，是免疫荧光染色、免疫组化、荧光原位杂交等实验的基础试剂，标记后不影响目标分子的天然结合活性。
流式细胞分析：标记流式抗体，用于细胞分选、细胞表型分析、细胞凋亡检测、细胞周期分析等流式细胞术实验，标记效率高，荧光信号稳定，检测结果准确性强。
荧光成像研究：标记靶蛋白探针，用于细胞免疫荧光成像、组织切片荧光成像、激光共聚焦显微镜🔬下的蛋白亚细胞定位追踪，适配体外细胞实验与离体组织检测。
生物探针与纳米材料修饰：标记含伯胺的靶向探针、纳米颗粒、脂质体等，赋予其远红光荧光示踪功能，适用于药物递送体系示踪、纳米材料体内外分布研究。

六、其它

[楚肽生物提供多种 Alexa Fluor 系列荧光染料及其修饰服务，服务范围包括：抗体荧光标记、多肽荧光标记、小分子荧光标记、蛋白荧光标记、糖类及其透明质酸类荧光等修饰服务。]