一、试剂基本信息
英文名称：Cyanine3.5 amine，Cyanine3.5 NH2，Cy3.5 amine，Cy3.5 NH2
中文名称：花青染料Cy5.5-氨基
分子式：C44H55ClN4O
分子量：691.4
激发波长：591 nm
发射波长：604 nm
货号：X-CL-1502
试剂规格：5mg，10mg，25mg
纯度等级：≥95%
外观描述：红色固体
存储条件：建议存放于-20℃以下环境，保持冰冻、干燥，并避光保存。
溶解性能：本产品溶于部分有机溶剂。
二、使用注意事项
1.请注意避免频繁解冻，建议现配现用，确保产品性能稳定。
2.使用过程中务必保持产品干燥，避免阳光直射。
三、试剂结构式：
四、核心结构与其衍生的特性
该化合物的核心是一个由奇数个碳原子组成的聚甲炔链，链上连接有两个含氮杂环结构。这种交替的单双键共轭体系是其光学性质的电子结构基础。末端的氨基通过一个烷基链连接至核心结构。此设计带来了以下特性：
水溶性平衡：磺酸基团的引入，使其在含水缓冲体系中具有良好的溶解性，同时保留一定的有机溶剂兼容性。
反应活性位点：伯氨基作为一个亲核中心，能够与多种亲电试剂发生反应，是实现定向标记的关键。
结构稳定性：刚性的共轭骨架提供了较好的光化学稳定性，相较于早期的一些荧光团，其对光照的耐受性有所提升。
五、偶联化学与应用策略
氨基的反应活性决定了其标记策略。
主要偶联路径：最常用的方法是与羧基活化酯（如 N-羟基琥珀酰亚胺酯，NHS ester）反应。在弱碱性缓冲液（如 pH 8.3-8.5 的碳酸氢钠缓冲液）中，Cyanine3.5 的氨基能够与待标记分子（如蛋白质、肽、寡核苷酸上的羧基经活化后）形成稳定的酰胺键。
其他反应：该氨基也可参与还原胺化反应，用于标记糖类或经氧化产生醛基的分子。
标记优化要点：成功的标记需要考虑染料与目标分子的投料比例、反应时间、温度及缓冲液成分。过度标记可能导致目标分子的生物活性改变或荧光自淬灭，因此需要通过预实验确定最佳条件，并进行纯化以去除未反应的染料。
六、主要应用场景概述
作为一种工具性分子，其主要服务于基础科学研究中的可视化与检测需求。
显微成像：用于共聚焦、宽场或全内反射荧光显微镜🔬。标记抗体、链霉亲和素或凝集素后，可用于观察细胞结构、蛋白质定位或动态过程。
流式分析：标记的配体或抗体可用于细胞表面或细胞内抗原的检测与分群。
生物分子相互作用研究：在荧光偏振、荧光共振能量转移（需与合适受体配对）或凝胶迁移变动分析等实验中，作为荧光报告基团。
核酸标记：通过中间连接体，可用于标记寡核苷酸探针，用于原位杂交或某些核酸检测技术。
材料科学：用于功能化纳米颗粒、水凝胶或聚合物，研究其分布或作为模型系统研究载体的性质。
七、相关试剂推荐
Sulfo-Cyanine7.5-FAPI-4
磺化-Cy7.5-成纤维细胞活化蛋白抑制剂-4
CY5-Dextran；Cyanine5-Dextran MW：70k
Cyanine3 cadaverine；脂性Cy3尸胺
400051-84-5；Cyanine5-Sulfo-NHS
Cyanine5一端连接磺酸一端连接活性酯
Sulfo-Cyanine7-Azide，Sulfo-Cy7-N3
Cy7 LEL；Cyanine7 Tomato lectin；花菁染料CY7标记的番茄凝集素
trisulfo-Cy3.5-carboxylic acid，三磺酸-Cy3.5-羧酸
Sulfo CYanine7 amine（Ethyl），sulfo CY7-NH2
sulfo-Cyanine 7 Deferoxamine；水溶性CY7-去铁胺
Cy3 Bis NHS ester，Cyanine3 Bis NHS ester
Cyanie3B NHS ester；Cy3B 活性酯；Cyanie3B 琥珀酰亚胺酯
Streptavidin, Cyanine5 conjugate；花菁染料Cy5链霉亲和素偶联物
Me-tetrazine-Cyanine5.5 (PF6)，Me-tetrazine-Cy5.5 (PF6)
Streptavidin, Cyanine3 conjugate；花菁染料Cy3链霉亲和素偶联物
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