尽管整个生产系统的蒸汽灭菌技术并非一项全新的技术，但在系统的设计或操作过程中仍可能存在潜在错误。这些错误可能会对过滤器产生严重影响，常见的问题：
（1）冷凝水的排放不充分；
（2）不冷凝气体（空气）的排放不充分。
冷凝水专篇
l 冷凝水的危害
饱和蒸汽具有气体的特性，能够轻易地通过过滤器。然而，一旦与任何低温表面（例如，不锈钢外壳或管道等）接触，蒸汽就会因冷却而产生冷凝水。特别是在蒸汽灭菌的初期阶段，所有表面都必须加热到所需的灭菌温度。在此期间，大量的蒸汽会转化为冷凝水。
- 冷凝水在蒸汽中以高速移动，其速度很容易达到20 m/s（即72 km/h）。如果液滴以这样的速度在阀门、弯头或其他装置上碰撞，它们能够产生数千公斤的局部压力，轻易地压碎钢材，并可能对人员或设备造成严重损害。
- 冷凝水还会阻碍亲水性或疏水性膜对蒸汽的流通，这可能会导致在高温环境下，由于膜两侧压差过大而损坏过滤器。
- 冷凝水温度会低于所需的蒸汽灭菌温度，对灭菌效果产生影响。因此，必须将冷凝水排除，以确保有效的蒸汽灭菌。
l 冷凝水的去除
冷凝水的去除，通常需要在硬件设备的布置上下足功夫。如下要求需要注意：
- 在设备本体和管道中安装蒸汽疏水阀或冷凝水排放装置，将它们设置在冷凝水可能积聚的上游和下游位置，即低洼处。
- 将所有管道安装成略微倾斜的状态（坡度为1:100至 1:200），利用重力原理使水得以汇集。
- 切勿在通往储罐或其他设备顶部的管道下端安装过滤器；在储罐或过滤器进行灭菌操作时，管道内会积聚冷凝水，从而淹没过滤器，有可能损坏过滤器滤芯。
- 减少过滤器中的蒸汽流量，在蒸汽灭菌后避免形成过多的冷凝水。在灭菌后控制过滤器元件的冷却，以避免因冷凝水导致过滤器堵塞（对于疏水性气体尤为重要）。
不可凝结气体（空气）专篇
l 不可凝结气体的影响
气体的热容远远小于蒸汽，不能被冷凝，不能释放由于冷凝而产生的潜热，气体低于冷凝温度，影响微生物的杀灭。
l 不可凝结气体的去除？
- 逐渐缓慢注入蒸汽，避免大的波动形成气体蒸汽混合物
- 在最低和最高点，管路末端设置排放阀和疏水阀（不可凝结气体的密度是蒸汽的1.6倍，蒸汽从高点进入，则气体从低点排出，结合向下的置换和向上的排放/混合，如下图）。
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