DusQ 1 amidite,5异构体在寡核苷酸合成和分子探针研究中具有重要应用

名称:DusQ 1 amidite,5异构体(晖瑞生物)

包装: 瓶装

适用范围:仅限科研实验使用

DusQ1 Amidite 5 异构体 是一种功能化核苷酸衍生试剂,在寡核苷酸合成和分子探针研究中具有重要应用。与普通的 DusQ1 亚磷酸酰胺不同,5 异构体指的是分子在特定结构位置存在异构体形式,这种微小结构差异会影响分子的光学特性和偶联效率。

1. 基本结构与异构体概念

  • 核心骨架:DusQ1 亚磷酸酰胺以脱氧核苷(通常是 dT 或类似核苷)为基础,末端引入亚磷酸酰胺基团,便于固相合成整合。
  • 5 异构体:在 DusQ1 分子中,某些位置(例如芳香环或荧光猝灭基团的连接位点)可能存在几何或立体异构体,称为 5 异构体。这种异构体可能会在吸收光谱、猝灭效率以及与核酸链结合的空间位阻上表现出差异。
  • 光学特性差异:不同异构体在吸收光谱的峰值、猝灭效率以及对供体荧光的调控能力上可能略有不同,实验设计中可以根据需要选择最合适的异构体。

2. 化学性质

  • 亚磷酸酰胺活性:5 异构体同样具备磷酸二酯键形成能力,可以与寡核苷酸链上的 5’-羟基反应,形成稳定的修饰核酸。
  • 猝灭特性:DusQ1 的荧光猝灭基团能吸收可见光范围内的能量而几乎不发光,5 异构体可能在猝灭效率上有轻微差异,但整体仍适合 FRET 探针体系。
  • 稳定性:干燥、无水条件下较稳定,但对水分敏感,需低温保存。

3. 合成与使用

  • 异构体形成:在 DusQ1 的化学合成过程中,由于连接方式或立体取向不同,会产生 5 异构体。可通过纯化和分离获得特定异构体。
  • 固相合成应用:5 异构体可以直接应用于自动化寡核苷酸合成中,用作功能化核苷酸的修饰单元,构建双标记或 FRET 探针。
  • 偶联反应:亚磷酸酰胺基团与固相支持物上的羟基反应形成磷酸二酯键,完成寡核苷酸链上的修饰。

4. 应用场景

  1. FRET 探针设计
  2. 5 异构体可以作为猝灭端,与荧光供体配对,调节荧光信号输出,实现核酸杂交或酶切事件的检测。
  3. 双标记寡核苷酸
  4. 可在寡核苷酸内部或末端引入 5 异构体,实现分子开关或结构变化监测。
  5. 荧光分析与生物检测
  6. 在实时荧光定量 PCR(qPCR)、核酸酶活性分析及核酸结构研究中提供可靠的信号调控手段。
  7. 材料科学与自组装
  8. 可嵌入 DNA🧬 自组装体系,用于分子逻辑门设计或纳米材料构建,发挥智能响应功能。

5. 操作与安全

  • 储存条件:低温干燥(–20℃)保存,避免水分和光照。
  • 溶解使用:通常在无水有机溶剂(如乙腈)中配制。
  • 实验操作:佩戴手套🧤和护目镜🥽,在通风环境下操作,防止化学品直接接触皮肤或眼睛。

6. 总结

DusQ1 Amidite 5 异构体是一种具有特殊立体结构的功能化核苷酸试剂,其亚磷酸酰胺活性允许在寡核苷酸合成中实现修饰,DusQ1 荧光猝灭特性使其在 FRET 探针和核酸标记中发挥作用。选择特定异构体可优化荧光猝灭效率和偶联效果,为分子探针设计和功能核酸研究提供多样化选择。

DusQ 1 amidite,5异构体

规格选择: 多种规格,包含50 mg、100 mg、250 mg、500 mg等

物理形态: 可根据需求提供固体、粉末或溶液形式

储存条件: 建议冷藏保存,以维持产品的稳定性和活性

推荐试剂: 环二肽3705-26-8,cyclo(Phe-Pro),环(L-苯丙氨酸-L-脯氨酸) 174881-57-3,BODIPY R6G Acid 1402795-92-9 Azido-mono-amide-DOTA-tris(t-Bu ester 478037-15-9,TE-L-Tyrosine (FET-precursor) DCL-PEG3-ADIBO,PET探针前体 Rhodamine-PEG-Amine RB-PEG-NH2

备注: 信息整理 / 编辑:kx

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