5-TAMRA alkyne,945928-17-6的化学反应特性与机理

5-TAMRA alkyne(化学名称:5-羧基四甲基罗丹明-炔基衍生物,CAS:945928-17-6)是一种在经典荧光染料 5-TAMRA(5-Carboxytetramethylrhodamine)的基础上引入了末端炔基(–C≡CH)修饰的衍生物。它兼具 罗丹明类染料的优异光物理特性 与 末端炔基的化学反应活性,是现代生物正交化学(Bioorthogonal Chemistry)和荧光标记实验中常用的功能分子。由于它能够参与“点击化学”(Click Chemistry),尤其是铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAC),因此在 生物分子标记、探针合成、药物递送与成像研究 中具有广泛的应用价值。

英文名 5-isomer TAMRA alkyne

CAS号 945928-17-6

分子量 467.516

分子式 C28H25N3O4

熔点 N/A

化学结构与基本特征

5-TAMRA alkyne 的主体是罗丹明(Rhodamine)类染料的核心结构,带有四甲基咔唑环,提供明亮而稳定的荧光信号。在 5-位羧基处通过化学修饰引入了一个末端炔基基团。这一结构赋予分子两个关键特性:

荧光特性:继承了 5-TAMRA 的强吸收和高量子产率,荧光信号明亮。

化学活性:末端炔基(–C≡CH)作为反应位点,可与叠氮(–N₃)化合物发生高效、选择性的“点击反应”。

化学反应特性与机理

5-TAMRA alkyne 的关键化学活性在于其 炔基基团。

反应:铜催化的叠氮-炔环加成(CuAAC)。

炔基与叠氮基团在 Cu(I) 催化下发生 [3+2] 环加成,形成 1,2,3-三氮唑结构。

该反应具有 高效、专一、温和条件下可进行 的特点,且副反应少。

应用:通过与叠氮修饰的蛋白质、多肽、核酸、糖类或纳米材料反应,可以实现荧光标记。

优势:

与常规的 NHS 酯、马来酰亚胺相比,炔-叠氮点击反应更为专一,避免了与生物分子中天然官能团(如胺基、巯基)的非特异性反应。

能在复杂生物环境中进行,适合生物正交标记。

生物学与化学应用

蛋白质标记

通过与叠氮化修饰的氨基酸或蛋白质进行点击反应,5-TAMRA alkyne 可作为共价标签,用于追踪蛋白质的定位与动态变化。

核酸修饰

在寡核苷酸、DNA🧬 或 RNA 中引入叠氮基团后,可通过点击反应与 5-TAMRA alkyne 偶联,生成荧光标记的核酸探针,用于分子诊断和荧光原位杂交(FISH)。

糖生物学研究

在糖分子上引入叠氮基后,5-TAMRA alkyne 能实现荧光标记,辅助研究糖链在细胞识别、信号转导及免疫反应中的作用。

药物递送与纳米医学

5-TAMRA alkyne 可与叠氮修饰的纳米颗粒(如金纳米粒子、聚合物、脂质体等)进行点击偶联,构建带有荧光功能的药物递送系统,实现对纳米载体的体内外可视化追踪。

活细胞成像

借助点击化学的生物正交性,5-TAMRA alkyne 可在活细胞条件下与叠氮修饰的代谢标记物反应,实现对代谢途径的实时成像。

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