脑细胞单细胞eQTL数据分析思路(脑组织单细胞测序)

2022年到2023年,随便下载一点eqtl数据或者pqtl数据与自己研究的疾病分析一下,基本有阳性结果就可以轻松发表在水刊上,这就好比2018年的纯生信,随便整几套GEO数据就可以轻松发表,想想都开心。不过,这种美好的日子都是暂短的。随着会做eqtl数据或者pqtl数据分析的人越来越好,文章出现了爆炸性的增长,SCI官方对期刊的监管越来越严格,导致期刊对纯的东西越来越不友好了,这种传统又简单的eqtl数据或者pqtl数据分析文章基本都是秒拒的。现在期刊对文章的创新性越来越高了,只有进行创新才会有新的出路。

现在我们来回顾一下传统eQTL分析能解决的问题:例如基因A促进疾病B的发生。这样的结论大家都会了,大家都能解决这样的问题,所以这种分析没有啥创新性。其实,传统eQTL分析存在明显的局限性:没有办法分析细胞类型特异性的基因调控对疾病的因果影响。

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