小儿癫痫总是在早上发作可能是由睡眠剥夺、夜间脑电图异常放电、遗传代谢障碍、脑皮质发育不全、脑白质营养不良等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。
1.睡眠剥夺
长时间未得到足够休息会导致神经细胞功能紊乱，进而影响大脑正常活动，可能导致早上出现癫痫发作。保证充足的睡眠时间有助于减少睡眠剥夺对身体的影响，通常建议学龄前儿童每天保持10-13小时的睡眠时间。
2.夜间脑电图异常放电
夜间脑电图异常放电可能表明存在癫痫或其他『神经系统』疾病的病理生理变化，在早晨容易诱发癫痫发作。通过脑电图监测可以记录到异常放电的情况，对于诊断和管理癫痫具有重要意义。
3.遗传代谢障碍
遗传代谢障碍是指由于基因突变导致体内酶缺乏或活性降低，从而引起代谢过程异常，包括脂肪酸氧化、氨基酸代谢等。这些异常可能会导致神经元受损，增加癫痫发作的风险。针对特定遗传代谢障碍的治疗需要个体化方案，如饮食调整或特殊配方食品，以优化患者的代谢状态。
4.脑皮质发育不全
脑皮质发育不全是由于胚胎期神经管闭合受阻引起的先天性脑部结构缺陷，可导致局部区域的功能异常，易发生异常放电而引发癫痫。MRI成像可用于评估脑皮质发育情况，指导制定合适的治疗计划。
5.脑白质营养不良
脑白质营养不良是一种遗传性疾病，由不同类型的基因突变引起，导致髓鞘形成不足或丧失，影响神经信号传导，此时在早晨时更容易出现癫痫发作。脑脊液穿刺术是获取患者脑脊液样本进行实验室分析的一种侵入性操作，有助于诊断某些代谢性脑病。
除以上提及的原因外，还应考虑是否存在电解质失衡的情况。建议定期进行血液电解质检测，以排除低钠血症或高钠血症的可能性。另外，如果患儿存在晨起头痛的症状，则需警惕颅内压增高的风险，可通过头颅CT扫描进一步确认。
