口臭刷牙后仍然存在可能与舌苔清洁不到位、牙周疾病、胃肠功能紊乱、扁桃体结石、鼻腔问题等因素有关。医学上称为呼气异味，刷牙只能清除部分口腔细菌和食物残渣，无法解决所有潜在病因。
舌背尤其是舌根部容易堆积大量细菌和脱落细胞，形成舌苔并产生挥发性硫化物。单纯刷牙无法有效清洁舌面，需要使用专用舌刮器由后向前轻柔刮除舌苔，并配合含锌离子的漱口水抑制细菌活性。
牙周炎会导致牙龈沟加深形成牙周袋，内部厌氧菌分解蛋白质产生尸胺等臭味物质。这类口臭常伴随牙龈出血、牙齿松动等症状，需通过牙周刮治清除牙结石，并配合使用甲硝唑含漱液和盐酸米诺环素软膏治疗。
胃食管反流或幽门螺杆菌感染时，消化道气体经食管溢出形成酸腐味口臭。这类患者多伴有腹胀、反酸等消化系统症状，需进行碳13呼气试验，常用药物包括奥美拉唑肠溶胶囊、胶体果胶铋胶囊和阿莫西林克拉维酸钾片。
扁桃体隐窝内积存的钙化物质含有大量厌氧菌，分解含硫氨基酸会产生臭鸡蛋气味。可通过喉镜检查确认，较小结石可用生理盐水冲洗，顽固性结石需考虑扁桃体切除术。
慢性鼻窦炎或鼻后滴漏综合征患者的鼻腔分泌物中的蛋白质被细菌分解会产生腐败气味。这类口臭在鼻腔通气时更为明显，需通过鼻内镜检查，并使用糠酸莫米松鼻喷雾剂和桉柠蒎肠溶软胶囊治疗。
建立每日晨起检查口气的习惯，用金属勺刮取舌根分泌物闻味辅助判断。饮食上适当增加苹果、芹菜等粗纤维食物促进自洁，避免洋葱、大蒜等强气味食物。定期进行口腔检查和洁牙，持续存在的口臭需排查消化内科和耳鼻喉科相关疾病。注意饮水杯和牙刷的清洁消毒，避免交叉感染。长期使用益生菌制剂可能有助于调节口腔和『肠道菌群平衡』。
